本片描述了香港反黑组的组员惩治罪恶的英勇事迹以及他们个人感情经历的点点滴滴。人称“筋肉人”的反黑组探员阿喜（吴毅将 饰）立功无数、屡破奇案，但却因脾气倔犟，向来专横而和同事们诸多不顺。刚刚加入的康仔（陈浩民 饰）更是对阿喜诸多怨言，甚至想申请调组。后来一起办案多了，反黑组内部终于彼此了解，一团和气。反黑组内也有不少情事，一次上司阿凡（黎耀祥 饰）结识了卖鱼女阿娇，两人成了欢喜冤家；而阿弟（邵美琪 饰）更是一直暗恋阿喜，他们在工作上、感情上正经历着一次又一次的考验。

　　继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。

　　本剧集故事主要讲述香港廉政公署力惩社会上各式各样的行贿贪污事件的故事，分为《造市》、《钉子户》、《维修大鳄》、《死亡保险》和《公·私·车》五个独立的故事单元。《造市》讲述了一起上市公司诈骗案，在廉署锲而不舍的追查下终于人赃并获。《钉子户》描写了一个市区重建贪污诈骗案的故事。《维修大鳄》则讲述了一宗楼宇维修贿赂案。《死亡保险》中廉署则破获了一起人寿保险跨境诈骗案。《公·私·车》讲述的是公职人员利用职权来谋取个人私利的案件。　　由香港电视广播有限公司与廉政公署合作拍摄的系列时装电视剧《廉政行动2009》，根据真实个案改编而成。众多TVB影视明星林保怡，宣萱，陈键锋，田蕊妮，郭羡妮，蒙嘉慧，杨千嬅，黄浩然等倾情加盟本剧。自1992年以来已出品七辑，ICAC的故事早已深入人心，成为观众最喜爱的电视娱乐节目之一。

　　阿东（欧阳震华 饰）在代课期间结识了名为阿红（邵美琪 饰）的女子，阿红个性泼辣，两人刚认识的时候因为一些矛盾产生了误会，但随着误会的解除，阿东和阿红之间的距离慢慢靠近，两人渐渐产生了感情，最终走到了一起。　　阿东的弟弟阿南（鲁文杰 饰）在网络上结识了名为阿兰的女孩，古灵精怪的阿兰一下子就吸引了阿东的注意，令阿东坠入了情网之中。然而，就在他们的感情逐渐升温之时，阿东震惊的发现，原来自己一直认真对待的感情，只是阿兰和好友们打的一个赌，深感遭到了戏弄的阿南愤怒的离开了阿兰。阿东和上司的情人阿喜（陈芷菁 饰）在无意之中成为网友，这层关系被上司发现后，阿东遭到了解雇。

　　明末崇祯年间，长平公主（佘诗曼 饰）与昭任公主跟着周后在民间生活，她们不得随意讲起自己的身世，昭仁时时怀念年幼时宫中的美好光景，善良的长平总是变着法子满足姐姐打扮自己的欲望。长平在铸炮坊重遇幼时玩伴周世显（马浚伟 饰），当年周后被贬的真相方才水落石出。母女三人获召回宫，世显亦入宫任教。然而当下局势动荡，世显被荐上战场。相爱的二人无奈再次分离。李自成攻陷京城，明朝灭亡，不久吴三桂又引清兵入关，大清建立。世显与长平虽然劫后重逢，如原成婚，然而他们的内心，早已抱持了一个坚定的信念……